E' importante che il ricercatore abbia buone conoscenze in: biologia, biochimica, chimica, ingegneria chimica e farmacologia. Perciò un possibile ostacolo può nascere dal fatto che chi cerca un brevetto biotecnologico può conoscere bene un aspetto dell'invenzione cercata ma non le altre. Ad esempio, un esperto di farmaci potrebbe non avere alcuna conoscenza di microbiologia.
Un altro ostacolo è dato dal linguaggio molto specifico.
Un motore di ricerca consigliato per trovare brevetti biotecnologici su l'acido nucleico e la sequenza della proteina è GenomeQuest. Questo motore di ricerca è a pagamento (1500, 3000 o 6000,- $ a secondo se si tratti di università, ente pubblico o azienda) ed è consultato da molte grosse società farmaceutiche. Esiste anche la possibilità di provarlo gratuitamente, previa iscrizione. In tal caso funzionerà solo al 20% delle sue reali possibilità.
Altre banche dati utili per trovare amminoacidi e sequenze proteiche sono:
- DGENE della Thomson Reuters.
- PCTGEN gestito dalla WIPO, l'Organizzazione mondiale della Proprietà Intelletuale.
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